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生態飼料的配制，需要從四個方面入手。
原料的合理選擇。飼料原料是加工飼料的基礎，選擇原料首先要保證原料的90%來源于已認定的綠色食品產品及其副產品，其他可以是達到綠色食品標準的產品；其次，要注意選購消化率高、營養變異小的原料。據測定，選擇高消化率的飼料至少可以減少糞尿中5%氮的排出量。再次是要注意選擇有毒有害成分低、安全性高的飼料，以減少有毒有害成分在畜禽體內累積和排出后的環境污染。
飼料的精準加工。飼料加工的精準程度對畜禽的消化吸收影響很大，不同的畜禽對飼料加工的要求是不一樣的。豬飼料顆粒在700μm~800μm之間，飼料的轉化率最高。采用膨化和顆�；庸ぜ夹g，可以破壞和抑制飼料中的抗營養因子、有毒有害物質和微生物，改善飼料衛生，提高養分的消化率，使糞便排出的干物質減少三分之一。
配制氨基酸平衡日糧。氨基酸平衡日糧，是指依據“理想蛋白質模式”配制的日糧。即日糧的氨基酸水平與動物的氨基酸水平相適應的日糧。在滿足有效氨基酸需要的基礎上，可以適當降低日糧的蛋白質水平。有研究資料表明，畜禽糞便、圈舍排泄污物、廢棄物及有害氣體等均與畜禽日糧中的組成成分有關。將豬日糧中的蛋白質含量每降低1%，氮的排出量則減少8.4%。如果將日糧中的粗蛋白含量從18%降低到15%，即可將氮的排放量降低25%。如果將雞的日糧中蛋白質減少2%，糞便排氮量可減少20%。糞便污染的惡臭主要由蛋白質的腐敗所產生，是日糧中營養物質吸收不全造成的，如果提高日糧蛋白質消化率或減少日糧蛋白質供應量，那么惡臭物質的產生將會大大減少。這不僅可以節省蛋白質資源，而且也是從根本上降低畜禽糞便氮污染的重要措施。
根據畜禽品種及其不同的生長階段配制日糧。動物不同的生長階段其營養需要差別很大，生產中要盡可能地準確估計動物各階段環境下的營養需要及各營養物質的利用率，設計出營養水平與動物生理需要基本一致的日糧，這是減少養分消耗和降低環境污染的關鍵。近年的許多研究報道表明，根據畜禽不同年齡、不同生理機能變化及環境的改變配制日糧，可以有效地減少氮磷的排放量。氨基酸需要隨畜禽年齡和生理狀態而異，要使氮的損失降到最低，必須經常調整氨基酸的供給量。對飼養種豬而言，實行階段飼喂對降低氮的排出是有益的，妊娠母豬對氮的需要量遠低于泌乳母豬，妊娠期重新配制日糧比使用同種日糧可降低氮的排出量15%~20%，且不影響繁殖性能。
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